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現今癌症分类主要以肿瘤来源组织的細胞类型和其生物学行为作为依据。在病理学上，每一个系统和器官的肿瘤都有详尽的分类。分类一方面是为了诊断的需要，统一术语。另一方面则是出于预后方面的原因。以下的類別較為一般所接受：

根據腫瘤的發展，可分成：

良性腫瘤 
惡性腫瘤 
良性腫瘤指腫瘤細胞未發生轉移與侵入周遭組織的情形，反之則稱為惡性腫瘤，多數會影響生理功能的腫瘤都是惡性腫瘤。

若是依據生成腫瘤的來源組織細胞分類，可分成四類：

上皮細胞 
間葉細胞 
血液幹細胞 
神經上皮細胞 
雖然幾乎各類型的細胞都有可能轉變成為腫瘤細胞，但是人類的癌症絕大部分都是源自於上皮細胞所產生的惡性腫瘤，這個類別包含大多數和許多常見的癌症，包括乳癌、攝護腺癌和肺癌。惡性上皮細胞腫瘤又可進一步分成惡性鱗狀上皮細胞腫瘤（一般的上皮細胞所轉變），與惡性腺瘤（來自於構成腺體的上皮細胞）。

其他並非源自於上皮細胞的惡性腫瘤有：

肉瘤（sarcoma）：由結締組織或來自中胚層的細胞所轉變而成的腫瘤。 
淋巴瘤和白血病（lymphoma、leukemia）：源自血液或骨髓細胞的腫瘤。 
間皮瘤（mesothelioma）：從位於腹膜或肋膜上的間皮細胞轉變的腫瘤。 
神經膠質瘤（glioma）：由神經膠質細胞變化成腫瘤，神經膠質細胞也是最主要的一種腦細胞類型。 
生殖細胞瘤（germinoma）：腫瘤來自生殖細胞，通常位在睪丸及卵巢。 
胎盤瘤（choriocarcinoma）：從胎盤細胞變化的腫瘤。 

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